泛基因組測序(Pan-genome)
泛基因組(Pan-genome)即某一物種全部基因的總稱，這里這個全部基因是有別于個體基因組的基因的。一個個體的基因組是這個物種基因組的代表。因此，以一個基因組為模板的分析不能全面的反應(yīng)物種基因水平的全部遺傳信息，尤其是在研究同一物種中差異巨大的不同亞種或者變種，此類特有片段的差異往往要比共有片段中的差異更為重要。分析核心基因和非核心基因的基本情況，并從特有基因序列的角度來研究物種內(nèi)的差異。
分析內(nèi)容：
（1）不同亞種的材料：可以研究物種的起源及演化等重要生物學(xué)問題
（2）野生種和栽培種等不同特性的種質(zhì)資源：可以發(fā)掘重要性狀相關(guān)的基因資源，為科學(xué)育種提供指導(dǎo)
（3）不同生態(tài)地理類型的種質(zhì)資源：可以開展物種的適應(yīng)性進(jìn)化，外來物種入侵性等熱門科學(xué)問題的研究，為分子生態(tài)學(xué)等學(xué)科提供新的研究手段
測序參數(shù)
一般采用二代+三代的測序策略，根據(jù)組裝目的一般建議一下策略：
泛基因組分析內(nèi)容
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